Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC14Q49A88 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms