Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms