Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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HIST2H2BEQ16778 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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HIST2H2BEQ16778 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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HIST2H2BEQ16778 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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HIST2H2BEQ16778 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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HIST2H2BEQ16778 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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HIST2H2BEQ16778 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIST2H2BEQ16778 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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