Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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