Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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