Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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