Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
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