Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EBI3Q14213 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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