Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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FAM53BQ14153 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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