Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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