Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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