Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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