Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TROQ12816 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROQ12816 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROQ12816 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TROQ12816 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TROQ12816 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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