Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms