Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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