Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms