Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms