Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms