Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMF1P82094 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMF1P82094 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMF1P82094 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms