Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms