Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms