Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBASH3AP57075 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBASH3AP57075 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms