Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms