Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRCC3P46736 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms