Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD52P43351 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAD52P43351 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms