Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC19A1P41440 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms