Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms