Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms