Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms