Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPRP12270 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRP12270 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRP12270 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms