Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD8BP10966 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD8BP10966 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms