Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms