Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PKHD1P08F94 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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