Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFMP07197 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFMP07197 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFMP07197 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFMP07197 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFMP07197 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFMP07197 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms