Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F13BP05160 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F13BP05160 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F13BP05160 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13BP05160 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms