Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOL3O95236 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOL3O95236 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOL3O95236 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms