Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP290O15078 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP290O15078 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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