Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms