Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QRK9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QRK9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms