Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER2I3L3R5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms