Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PRAMEF25A6NGN4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PRAMEF25A6NGN4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PRAMEF25A6NGN4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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