Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms