Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms