Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR55Q9Y2T6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms