Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms