Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD1Q9UIS9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms