Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms