Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUX4Q9UBX2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms