Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSFQ9UBX1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms