Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms